Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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