Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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