Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms