Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms