Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZYG11BQ9C0D3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms