Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT23Q9C075 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms