Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms