Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms