Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms