Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms