Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNL2Q96S94 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms