Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms