Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms