Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF34Q969K3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms