Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms