Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms