Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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