Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms