Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNE4Q8N205 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms