Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLD3Q8IV08 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLD3Q8IV08 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms