Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms