Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC141Q6ZP82 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms