Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms