Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms