Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms