Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms