Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms