Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTXN3Q4LDR2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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