Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms