Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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