Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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