Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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