Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms