Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms