Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms