Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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