Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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