Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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