Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC23BQ15437 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms