Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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