Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GAPVD1Q14C86 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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