Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms