Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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