Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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