Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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