Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms