Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms