Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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