Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CBX3Q13185 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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