Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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